• Shuffle
    Toggle On
    Toggle Off
  • Alphabetize
    Toggle On
    Toggle Off
  • Front First
    Toggle On
    Toggle Off
  • Both Sides
    Toggle On
    Toggle Off
  • Read
    Toggle On
    Toggle Off
Reading...
Front

Card Range To Study

through

image

Play button

image

Play button

image

Progress

1/358

Click to flip

Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;

Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;

H to show hint;

A reads text to speech;

358 Cards in this Set

  • Front
  • Back

Pseudomurein

Arké cellvägg

Peptidoglukan

Bakterier cellvägg

Plasmid

Ringformat DNA hos bakterier, som kan överföras mellan bakterier. Vissa innehåller gener för antibiotikaresistens.

Pili

Tunna, korta, trådliknande utskott på utsidan av bakterier som hjälper till vid adhesion och konjugation.

Endosymbios

Prokaryota celler som upptar en annan och lever i symbios. Endosymbiontteorin är en förklaringsmodell för eukaryota cellers uppkomst, som baseras på mitokondriers och kloroplasters egna DNA.

LUCA

Last Universal Common Ancestor

Cyanobakterier

De första aeroba fotosyntetiserande organismerna.

Stromatolit

Skikt av mattor med fossila mikroorganismer (tex cyanobakterier)

Extremophil

Archaea som föredrar extrema miljöer

Kryofil

Archaea som föredrar köld under +15°C

Termofil

Archaea som föredrar värme, +20-+45°C

Halofil

Archaea som föredrar hög salthalt i miljön

Acidofil

Archaea som föredrar lågt pH, dvs sur miljö

Metanogener

Archaea som lever i anaeroba miljöer, producerar metangas i magen på nötkreatur

Chaperoner

Proteiner som hjälper till med veckningen av andra proteiner

Virion

Viruspartikel (extracellulär)

Kapsid

Skyddande proteinhölje runt ett virus arvsmassa

Kapsom

Proteinsubenhet i kapsiden hos virus

Reassortment

Två olika virus som infekterat samma värdcell som byter RNA-bitar och genom replikation bildar ett nytt virus.

Persistent infektion

Långsam frisättning av virioner, dödar inte värdcellen

Latent infektion

Viruset har penetrerat värdcellen men replikerar inte.

Transformerad cell (av virus)

Muterat cellen till cancerceller, replikeras.

Granulae

Korn i bakteriecytoplasman som lagrar kol- och kväveöverskott

Integrala membranproteiner (bakterier)

Ligger i membranet, vanligtvis inblandade i stabilisering eller energiproduktion

Perifera membranproteiner (bakterier)

Förankrade i membranet, interagerar med världen utanför

Antiport

Transport av näring in/ut ur bakteriecellen. Transport av två molekyler i motsatt riktning.

Uniport

Transport av näring in/ut i bakteriecellen. Transport av en molekyl i en riktning.

Symport

Transport av näring in/ut i bakteriecellen. Transport av två molekyler i samma riktning.

LPS

Lipopolysackarid. Ett endotoxin i membranet hos G- bakterier.

Endotoxin

Läcker ur bakterien vid dess död, och kan orsaka starka reaktioner hos värdens immunförsvar.

Peritrick

Flagellernas placering runt bakterien, riktade åt samma håll.

Polär flagell

Flagellernas placering på bakterien, enstaka vid ena änden.

Lofotrick

Flagellernas placering på bakterien, två eller flera vid ena eller båda polerna.

Periplasmautrymme

Utrymmet mellan cellväggen och yttermembranet hos Gram-negativa bakterier. Innehåller transport-, nedbrytnings- och uppbyggnadsenzymer.

Penicillin

Antibiotika som hämmar cellväggssyntes

Lipoteikonsyra

En del av cellväggen hos Grampositiva bakterier

Karboxylgrupp

-COOH. Ändan av en fettsyramolekyl.

Homeostas

Konstant inre miljö (hos celler)

Adenin

Kvävebas, purin. Binder till Thymin/Uracil i DNA/RNA

Thymin

Kvävebas, pyrimidin. Binder till Adenin i DNA.

Cytosin

Kvävebas, pyrimidin. Binder till Guanin i DNA/RNA.

Guanin

Kvävebas, purin. Binder till Cytosin i DNA/RNA.

Uracil

Kvävebas, pyrimidin. Binder till Adenin i RNA.

Vätebindning

Kemisk bindning mellan molekyler. Stark dipolbindning.

Van der Waals bindning/kraft

Grundläggande svag attraktiv kraft som påverkar interaktioner mellan atomer/molekyler, främst opolära.

mRNA

Messenger RNA. Den komplementära strängen till DNA som kopieras vid transkriptionen, i cellkärnan hos eukaryota transporteras mRNA till cytoplasman efter transkription.

Transkription

Avläsning, och kopiering av DNA mha mRNA (i cellkärnan hos eukaryota). Processering och transport till ribosomer sker också.

Tata box

En vanlig promotorsekvens som förekommer i kromosomer hos archaea och eukaryoter.

Promotor

Den sekvens av baspar framför en gen som reglerar genens uttryck. RNA-polymeraset binder här vid initieringen av transkription.

RNA-polymeras

Enzym som binder till promotorn och styr tillverkningen av mRNA som är komplementärt till genen under transkriptionen.

Transkriptionsfaktorer

Proteiner som hjälper till vid transkriptionen av DNA till mRNA.

Intron

DNA-sekvenser son inte kodar för proteiner, som klipps bort mha spliceosomer

Spliceosom

Mekanism (RNA) som klipper bort introner från mRNA och klistrar ihop delarna mha ATP.

5' cap

Sätts på 5' änden av mRNA efter transkription, underlättar mRNAs transport ut ur cellkärnan. Skyddar också mot degradering och hjälper bindningen av ribosomer (vid translation).

Poly A svans

Sätts på 3' änden av mRNAt, signalerar att introner ska avlägsnas.


Skyddar mot degradering av mRNAt, hjälper också vid transport ut ur cellkärnan.

Kodon

En sekvens med 3 baser som kodar för en specifik aminosyra

Exon

Sekvens av DNA som kodar för en gen som uttrycks (vs introner)

Pre-mRNA

m-RNA innan postbehandling (introner, 5' cap, poly A osv)

rRNA

Ribosomalt RNA som tillsammans med proteiner bildar ribosomerna.

Binding site

Siten där mRNA binder till ribosomerna vid translation

tRNA

Transfer RNA, transporterar aminosyror till ribosomerna vid translation. Varje kodon motsvaras av ett tRNA. Ena änden består av konplementär nukleotidsekvens (antikodon) och andra änden binder rätt aminosyra.

Antikodon

Komplementär nukleotidsekvens på tRNA-molekyler.

Metionin

Aminosyra som fungerar som startkodon. AUG.

Peptidyltransferas

Enzym som bildar peptidbindningar mellan aminosyrorna på tRNA

Bindningsställen A P, E

A - binder kodonet (aminoacyl)


P - peptidbindning sker (peptidyl)


E - bindning som släpper det använda tRNAt (exit)

Polyribosom

Även kallas polysom. Flera ribosomer som arbetar på samma mRNA-sträng

Stoppkodon

Binder en protein release factor som hydrolyserar bindningen mellan polypeptiden och tRNA i bindningsställe P.

Signalsekvens

Talar om var proteinet har sin slutdestination.

Proteolysering

Proteaser klipper proteiner för att ge den sin rätta form och struktur

Glykolysering

Socker sätts på en proteinkedja för att ge den sin rätta form och struktur

Fosforylering

Fosfattgrupp sätts på en proteinkedja för att ge den sin rätta form och struktur

Rough endoplasmatiskt retikulum

Organell i anslutning till cellkärnan. Huserar ribosomer. Här sker polypeptidsyntesen.

Nukleolus

Ribosomsyntes. RNA + proteiner.

Smooth endoplasmatiskt retikulum

Sitter ihop med RER.


Avgiftning.


Fosfolipider.


Nedbrytning av glykogen.


Steroidsyntes.


Kalciumupplagring.

Peroxisom

Väteperoxid upp/ner. Endosymbios.

Katalas

Bryter ned väteperoxid till syre och vatten. Finns i peroxisomen.

Oxidas

Bildar väteperoxid. Finns i peroxisomen.

Lysosom

Lyserar/bryter ned stora molekyler och extracellulärt material. Lågt pH och starka enzymer. Transporteras från golgi i endosomer.

Endosom

Transportpartikel från golgi med möjligheten till lågt pH inuti, vilket behövs för tex lysosomers enzymer.

Golgiapparaten

Proteinmodifikation. Glykolysering. Signalsekvens"flaggor".

Mitokondrier

Energiproduktion.


Citronsyracykeln (matrix), oxidativ fosforylering (innermembran). Eget DNA och ribosomer (matrix). Yttermembran - intramembranutrymme - cristae - innermembran - matrix.

Cristae

Kraftigt veckat innermembran hos mitokondrien, som ökar dess yta avsevärt.

Poriner

Kanalproteiner i mitokondriers yttermembran

Cytosol

Semiflytande substans inuti cellen med organeller. Ger cellen sin form och stadga, möjliggör rörelse och transport av ämnen. Glykolysen sker här.

Vesikel

Transportblåsa

Cytoplasmatisk streaming

Cytosolens rörelse, vilket möjliggör rörelse och transport av ämnen och organeller.

Cytoskelett

Komplext nätverk av proteiner i cytosolen. Ger cellen dess form och möjliggör rörelse.

Mikrotubuli

Proteinstruktur i cytoskelettet. Tjockt. Flageller, cilier, spindelfibrer som separerar kromosomerna vid celldelning. Spelar viktig roll för cellens form.

Mikrofilament

Proteinstruktur i cytoskelettet. Finns mycket av, är tunnare. Viktiga i muskelceller. Kan fästa vid cellmembranet och göra cellen rörlig. Delar cytoplasman vid celldelning.

Intermediärt filament

Proteinstruktur i cytoskelettet. Mest stabil och klarar belastning.

ECM

Extracellulärt matrix. Håller samman celler i vävnad. Strukturella proteiner, proteoglykaner, glykoproteiner. Singalöverföring.

Plasmamembran

Selektiv permeabel barriär. Skyddar cellenn ger den dess form och struktur. Möjliggör homeostas. Endocytos, exocytos. Rörlig och flexibel. Bidrar till cellsignalering.

Exocytos

Utsöndra. Vesikel vandrar till cellytan och membranet i vesikeln går ihop med plasmamembranet. Innehållet i vesikeln töms och blåsans membran blir en del av plasmamembranet.

Endocytos

Upptagning. Motsats av exocytos. Görs av tex vita blodkroppar och leverceller. Kan ske via fagocytos.

Fagocytos

Cellätande. Stora partiklar innesluts av veck i plasmamembranet och partiklarna internaliseras.

Transcytos

Transport genom celler.

Flytande mosaikmodellen

Mosaik syftar på de olika molekylerna som bildar membranet (bla fosfolipider, kolesterol, proteiner och kolhydrater). Det flytande syftar på att de olika molekylerna bildar en dynamisk och flexibel vätska med diverse olika uppgifter och ansvarsområden.

Fosfolipid

Två fettsyror, glycerol och en laddad fosfatgrupp som huvud. Huvudet är polärt och därmed hydrofilt, medan fettsyresvansen är hydrofob. Därför arrangerar fosfolipiderna sig i dubbellager med svansarna riktade inåt, bort från vattnet inuti och utanför cellen, medan huvudet är riktat utåt.

Membran

Semipermeabel barriär

Kanalprotein

Hydrofila kanaler. Öppnas när en ligand eller jon binder till proteinet.

Permeaser

Bärarproteiner i membran. Konformationsförändring sker när ligand binder.

Ligand

Molekyl som triggar en signal genom att binda till ett receptorprotein.

Signal transduction pathway

En serie signaler (signalkaskad) som sker som en konsekvens av att en receptor binder en molekyl, som i slutändan triggar en reaktion.

Diffusion

Passiv transport (hög till låg koncentration). Strävan efter jämvikt.

Aktiv transport

Transport mot koncentrationsgradienten (låg till hög), kräver energi

Osmos

Strömning av lösningsmedel (tex vatten) från låg till hög koncentration, då partiklar inte kan röra sig genom ett semipermeabelt membran.

Isoton

Jämvikt med avseende på koncentration inuti och utanför ett membran (en cell)

Hyperton

Lägre koncentration inuti cellen än utanför, vatten vill röra sig ut ur cellen (salt miljö tex)

Hypoton

Högre koncentration inuti cellen än utanför; vatten vill röra sig in för att späda ut (kan spränga cell)

Faciliterad diffusion

Passiv transport från låg till hög koncentration, som faciliteras av hydrofila porer (kanalproteiner eller bärarproteiner) i membranet

Primär aktiv transport

Energin kommer från hydrolys av ATP, sköts av Na/K-pump

Sekundär aktiv transport

Energin kommer från jonkoncentrationsgradient som har bildats genom en tidigare primär aktiv transport

Tight junctions

Tät förbindelse mellan celler, består av aktin och glukoprotein som bildar nätverk.

Desmosomer

Ger slitstyrka åt cellen och bidrar till cellsignalering mellan celler. Intermediära filament.

Gap junctions

Utgör jonkanaler mellan celler, vilket medför att cellsignalering kan ske mellan många celler direkt. Muskler och hjärtats vävnader har många för snabb impuls.

Integrin

Förmedlar cell-matrix och cell-cell interaktioner.

Basalmembran

Mycket tunn hinna av kollagen, proteoglukaner och glykoproteiner. Kopplar samman epitelcellerna med bindväv.

Autokrina

Signal med kemisk budbärare från cellerna som påverkar sig själva.

Parakrina

Signaler med kemisk budbärare som påverkar närliggande celler

Juxtakrina

Signaler med kemisk budbärare som påverkar tätt intilliggande celler.

Endokrina

Signaler med kemisk budbärare som påverkar celler långt borta.

Jonkanal

Port i plasmamembranet som kan släppa igenom joner. Kan öppnas ich stängas under påverkan av elektrisk spänning, läkemedel, signalsubstanser, eller mekanisk belastning

Proteinkinasreceptorer

Receptor som binds av proteinkinas genom fosforylering

G-protein-lånkade receptorer

En typ av receptor på ytan av cellmembranet.

Direkt signalering

Intracellulär signalering som regleras av gap junctions (djurceller) eller plasmodesmata (växtceller)

Indirekt signalering

Intracellulär signalering som sker med kemisk budbärare antingen autokrint, parakrint, juxtakrint eller endokrint.

Active site

Platsen på ett substrat där ett enzym binder för att trigga en reaktion.

Inhibitor

Molekyler som binder till enzymet och förhindrar dess katalyserande effekt eller gör den avsevärt långsammare. Naturligt förekommande inhibitorer reglerar metabolismen, medan artificiella inhibitorer används för att behandla sjukdomar.

Kompetitiv inhibitor

Tävlar om att binda till active sitet på enzymet, och sänker därmed antalet/effekten av katalyserande reaktioner.

Icke-kompetitiv inhibitor

Binder på en annan plats än active site på enzymet, men försvårar ändå bindningen av substratet (genom att tex ändra formen på enzymet).

Reversibel bindning

Hämmaren (inhibitorn) binder inte så starkt till enzymet utan kan släppa.

Irreversibel bindning

Hämmaren (inhibitorn) binder kovalent (starkt) till sidokedjor i den aktiva platsen i enzymet och inaktiverar enzymet permanent, cyclooxygenase binder med aspirin

Feedback inhibition

När slutprodukten i en signal transduction pathway agerar som inhibitor, för att förhindra överproduktion av produkten

Cofaktor

Faktor som binder till enzym och möjliggör därmed dess katalyserande funktion. Tex järn, koppar och zink som binder hemoglobin.

Coenzym

Binder till ett annat enzym och möjliggör därmed dess katalyserande funktion, ex biotin.

Anabolism

Uppbyggnad av ämnen, kräver energi

Katabolism

Nedbrytning av ämnen, ger energi (byggstenar till anabolism)

Oxidativ fosforylering

Steget i cellandningen som producerar ATP >30/C⁶H¹²O⁶

Oxidation

Borttag av elektroner/vätejoner (protoner)

Dehydrering

Borttag av vatten

Reduktion

Tillsats av elektroner

Anaerob

Reaktion som sker utan syre

Aerob

Reaktion som sker med syre

Redoxreaktion

Reaktion där oxidation och reduktion sker samtidigt

ATP

Adenosintrifosfat. Den universella energidonatorn. Uppbyggd av en adenosin och tre fosfat. Har en energirik bindning mellan fosfatgrupperna som används för att driva energikrävande processer i cellen. Bildas under glykolysen, citronsyracykeln och elektrontransportkedjan.

Glykolys

Nedbrytning av glukos till pyruvat, första steget i cellandningen. Sker i cytoplasman, aerobt/anaerobt. Ger 2 pyruvat och 2ATP per glukosmolekyl

Pyruvat

Slutprodukten av glykolysen, som genom omvandling till acetyl-CoA används som startprodukt i citronsyracykeln.

Acetyl-CoA

Mellanprodukt under cellandningen. Glukos bryts ned till pyruvat genom glykolysen, som i sin tur omvandlas till acetyl-CoA genom pyruvathydrogenaskomplexet. Acetyl-CoA är en av startprodukterna för citronsyracykeln.

Citronsyracykeln

Aerob metabolisk process där 2 Acetyl-CoA blir citronsyra och sedan omvandlas till koldioxid, 6 NADH, 2 FADH och 2 ATP. Sker i mitokondiernas matrix.

NADH

Intermediär elektronbärare i metaboliska processer.

FADH

Intermediär elektronbärare i olika metaboliska processer

Elektrontransportkedjan/ATP-syntes

Protoner transporteras aktivt mha NADH, ansamlas i intramembranutrymmet i mitokondrier. Detta skapar en koncentrationsgradient och laddningsskillnad (potentiell energi) på båda sidorna om innermembranet. ATP-syntas tar aedan vätejoner med gradienten in i mitokondrien och energi frigörs. Bildar > 30 ATP för varje glukosmolekyl.

ATP-syntas

Enzym som katalyserar bildandet av ATP från ADP, det sista och mest centrala steget i cellandningen. Sitter i mitkondriernas innermembran.

Pyruvatoxidation

Omvandling av pyruvat till Acetyl-CoA. Kräver syre.

Fermentering

Anaerob omvandlingsprocess som används när respiration inte är tillgängligt. Ex, mjölksyrajäsning eller fermentering som ger alkohol. Sker hos människan vid stor ansträngning av musklerna där syre förbrukas i högre takt än det tillkommer genom blodet. Producerar små mängder ATP.

Elektronacceptor

Ämne som katalyserar en oxidation. Tex syre, sulfat, nitrat, järn.

Fermentationsprodukt

Etanol eller mjölksyra

Psychrophil

Temperaturberoende mikroorganism. Behöver låg temperatur.

Mesophile

Temperaturberoende mikroorganism. 8-47°C, tex kroppen och rumstemperatur.

Thermophile

Temperaturberoende mikroorganism. Behöver högre temperatur, 42-68°C.

Hyperthermophile

Temperaturberoende mikroorganism. Behöver väldigt hög temperatur.

Neutrophile

Mikroorganisms anpassning till pH. Neutralt pH.

Acidophile

Mikroorganisms anpassning till pH. Surt pH.

Alkaliphile

Mikroorganisms anpassning till pH. Basiskt pH.

Halofil

Kräver salt miljö

Obligat

Tvungen att leva där (tex obligat aerob måste ha syre)

Fakultativ

Kan utnyttja mekanismer i både aeroba och anaeroba miljöer

Reverse DNA gyrase

Enzym som katalyserar supercoiling av DNA, vilket skyddar det från denaturering i höga temperaturer. Speciellt hos Thermo- och Hyperthermophiler

Viable count / colony building units

Levande bakterier

Laggfas

Första fasen av bakterietillväxt efter ympning ner i nytt medium. Bakterierna anpadsar sig till den nya miljön innan de kan börja dela sig. Under denna period syntetiseras proteiner.

Exponentiella fasen

Den andra fasen i bakteriers tillväxt. Bakterierna stiger i antal exponentiellt. De delar sig i stora antal och väldigt få dör.

Stationär fas

Tredje fasen i en bakterietillväxt. Näringen sinar och tillväxtkurvan planar ut. Flera börjar dö ut, och många har svårare att dela sig.

Dödfasen

Fhärde och sista fasen i bakteriers tillväxt. Tillväxrkurvan går nedåt och fler och fler dör allt eftersom delningen sjunker.

100 mikroliter => 17 levande


Spädningsserie 1/10 i fyra steg. Hur många viabla per ml i ursprungskultur?

17/100 mikroliter = 170/ml


Spädning: 1/10×4 => 10 000



=> 170 0000 viabla/ml

Semikonservativ replikation

När de två strängarna i DNA-helixen replikeras består de två nya helixarna båda av en gammal och en ny DNA-sträng

Histon

Proteiner som håller ihop packstrukturen. DNA dubbelhelixen är virad runt histoner i G0/G1-fas av replikationen

Nukleosom

DNA virat runt histoner och tätt ihoppackat kallas för nukleosomer.

Kromatin

Flera nukleosomer ihoppackade kallas för kromatin.

G0

Vilofas

G1

Interfas, tillväxtfas. Tillverkning av strukturella och enzymatiska proteiner som ska användas i syntesen.

S

Interfas. DNAt replikeras, centrosomer bildas.

G2

Interfas. Mitosförberedelser så att systerkromatiderna ska kunna separeras. Här görs även organeller och strukturella och enzymatiska proteiner.

M

Celldelning/mitos

Transfektion

Överföring av DNA till eukaryoter kallas för transfektion

Polymer

Kemisk förening som består av långa kedjor av upprepade mindre enheter - monomerer. Reaktionen då monomererna blir polymer kallas för polymerisation.

Ori

Origin of replication. Starten på replikationsgaffeln. Eukaryota celler har multipla ori.

Primas

Bildar kort RNA-primer som fungerar spm startbit för DNA-replikationen. Behövs av DNA-polymeraset för att börja arbeta.

Sliding DNA clamp

Rör sig längs replikationen och stabiliserar ihop den nya dubbelsträngen och dess bindningar

Lagging strand

5' till 3'. Blir små stumpar av DNA

Leading strand

3' till 5'

DNA polymeras

Syntetiserar nya komplementära DNA-strängar

Okazakifragment

Stumparna av DNA på lagging strand som uppstår pga att DNA polymeras enbart kan arbeta från 3' till 5' (sett till replikationsgaffeln

Single strand binding protein

Håller de separerade enkla strängarna isär under replikationen

DNA helikas

Separerar dubbelsträngen till två enkelsträngar (bildar replikationsgaffeln)

Ligas

Limmar ihop okazakifragmenten

Telomeras

I änden av lagging strand blir en liten lucka där nukleotider saknas vid varje replikation, varje kromosom blir alltså kortare vid varje replikation. I könsceller och stamceller som replikeras ofta åtgärdas detta mha telomeras som sätter dit en bit som heter telomer.

Proofreading

DNA polymeraset har en inbyggd korrekturläsningsfunktion som innebär att den kan byta ut felaktigt insatta nukleotider.

PCR

Polymerase chain reaction. Används för att detektera och multiplicera arvsmassa. Cykler av upphettning och nedkulning, vilket denaturerar respektive syntetiserar DNA. Används för att hitta specifika sekvenser, och för att göra mycket DNA för kloningsexperiment.

Kromosom

Två kromatider

Kromatid

En dotterkromosom

Kromatin

DNA + proteiner

Mitos

Celldelning. Cellerna blir genetiskt identiska. Ett av stegen i cellcykeln, sker när nya celler ska bildas. Sker tex när organismen växer och när gamla celler måste ersättas. Diploid genom. Varje somatiska cell innehåller homologa par kromosomer (kromatider).




Profas


Prometafas


Metafas


Anafas


Telofas

Profas

Kromatinet kondenserar/viras ihop och blir kompaktoch bildar synliga kromosomer, som består av parade systerkromatider (som delar på centromer). Centrosomerna flyttar sig till motsatta poler

Prometafas

Nukleärmembranet bryts ned. Mikrotubuli kopplar kinetochorerna till polerna

Centromer

DNA-sekvens som kopplar samman systerkromatider

Kinetochor

Fästpunkt på kromatiderna för mikrotubuli/spindelfibrerna vid celldelning (prometafas)

Metafas

Den mitotiska spindeln bildas. Centromererna lägger sig i centrialplanet vid cellens ekvator.

Anafas

Systerkromatiderna separeras och dras åt varsitt håll

Telofas

Två nya kärnmembran bildas och kromatinet luckras upp så att DNAt kan läsas av

Cytokines

Cellmembran (cellvägg hos växter) bildas och cellerna separerar

Cyklinberoende proteinkinas

Cyklin-proteiner aktiverar CdK, som i sin tur aktiverar andra proteiner. Kinaser är enzymer som fosforylerar, dvs överför en fosfatgrupp från ATP till ett målprotein så att det händer något med dess funktion - aktivering eller inaktivering.

Apoptos

Programmerad celldöd. Viktigt för att ta bort skadade celler. Katalyseras av caspaser

Caspaser

Enzymer som katalyserar apoptos

HER2

Aktiverar onkogener (cancer)

RB

Inhiberar tumörsupressorgener (cancer)

Strålning

Cancerbehandling som skadar DNA och ger apoptos

Cellgifter

Cancerbehandling som riktar sig mot olika steg i cellcykeln, tex blockerar DNA replikationen, blockerar mitotiska spindeln, binder HER2

Somatiska celler

Kroppens celler förutom könsceller

Meios

Sexuell reproduktion. Cellerna blir genetiskt unika. Reduktionsdelning, den delning som sker när det bildas könsceller. Haploid genom.

Haploid

Enkel uppsättning kromosomer

Diploid

Dubbel uppsättning kromosomer

Asexuell reproduktion

Ger genetiskt identiska individer, sker tex hos bakterier, kloner av växter

Sexuell reproduktion

Ger genetiskt unika, haploida gameter, som smälter samman till em diploid cell.

Gameter

Könscell, haploid

Zygot

Den cell som bildas när två gameter (vanligen ägg och spermie) förenas vid befruktning. Zygoten har till skillnad fråm gameterna dubbel kromosomuppsättning.

Profas 1

Mitos 1. En replikation av arvsmassan har skett. Homologa kromosomer parar ihop sig och fäster sig till varandra via synapser. Kromatinet coilar ihop sig och blir mer kompakt.

Metafas 1

Homologa kromosomer hålls ihop av cohesin vid regioner som kallas chiasmata. Arvsmassebitar byts ut genom rekombination.

Cohesin

Proteinkomplex som håller ihop systerkromatider fram till anafas när de separerar

Chiasmata

Region där homologa kromosomer hålls ihop under metafas 1 av meiosen

Rekombination / crossing over

Sker mellan kromatider mha chiasmata, där bitar av arvsmassa byts ut genom repellering oxh överkorsning, vilket ger en rekombinant kromatid.

Anafas 1

De nya kromosomerna dras åt motsatt håll

Telofas 1

De två nya (diploida) cellerna delar på sig

Tetrad

Fyra kromosomer

Metafas 2

Kromosomparen dras till ekvatorialplanet och spindelfibrer fäster till kinetochorerna

Anafas 2

Det återstående cohesinet bryts ned vilket möjliggör att systerkromatiderna separerar. De rekombinerade kromosomparen dras åt motsatt håll

Telofas 2

Nukleärmembran och fyra haploida celler bildas

Profas 2

Nukleärmembranet bryts ned. Centrosomer dras till motsatta poler

Genetisk variation

1. Kromosomer från det maternella respektive paternella arvet lägger sig längs ekvatorialplanet "slumpmässigt" på varsin sida


2. Crossing over i metafas

Enäggstvillingar

Samma arvsmassa, utgår från en zygot

Tvåäggstvillingar

Samma relation som vanliga syskon, utgår ifrån två zygoter

Monosomi

Bars en kromosom på ett av paren (tex äggcellen har inga kromosomer). Monosoma zygoter dör.

Trisomi

Extra kromosom på ett av kromosomparen (äggcellen hade två kromosomer). Trisomiska zygoter kan överleva beroende på vilken kromosom det handlar om, exempelvis i kromosom 21 leder trisomi till Downs syndrom.

Aneuplodi

Onormalt antal kromosomer. Aneuploda celler dör oftast, men inte alltid.

Karyogram

Kromosomkarta, visualisering av hur kromosomer ser ut (under M-fasen) hos en organism

Karyotyp

Nummer och utseende hos en kromosom

Allel

En särskild variant av genen/anlaget. Varje kromosompar har i båda kromosomerna motsvarande alleler, dvs tex genen för röd färg sitter på samma position på båda kromosomerna

Lokus

Den bestämda plats på kromosomen där information om en viss gen är lagrad. Gener med ett och samma lokus i homologa kromosomerna är alleler av samma gen

Homozygot

Samma allel för en gen i båda av de homologa kromosomerna (tex två för brunögdhet)

Heterozygot

Två olika alleler för samma gen i de homologa kromosomerna

Recessiv

Ett anlag som inte slår igenom om dominant anlag finns (dvs kräver homozygot)

Dominant

Anlag som alltid slår igenom om det finns (både homozygot och heterozygot)

Genotyp

Syftar på hela arvsmassan, även DNA och gener som inte ger synliga egenskaper

Fenotyp

Syftar på de egenskaper som man kan se, alltså de gener som ger synliga egenskaper, även miljöfaktorer tas in

Könsbunden ärftlighet

Genen sitter på könskromosomen X eller Y

Autosomal ärftlighet

Genen sitter inte på könskromosomen

Law of segregation

Gameter blir haploida genom meios. Gameter sammansmälter till en diploid zygot. För varje egenskap ärver en individ två alleler, en av varje förälder

Law of dominance

Vissa allelers gener är dominanta, de maskerar de recessiva generna

Law of independent assortment

Vissa gener ligger skilda på olika kromosomer eller långt ifrån varandra på samma kromosom, och separeras genom rekombination. Då ärvs de oberoende från varandra.

Monohybrid korsning

Två möjliga alleler (två genvarianter på ett ställe, korsschema med fyra rutor)

Dihybrid korsning

Två möjliga alleler vid två loci (två olika genvarianter på två ställen) (korsschema 16 rutor)

Icke-komplett dominans

Inget anlag är recessivt.


R - röd


V - vit


RR + VV = RV = rosa (en blandning)

Co-dominans

Inget anlag är recessivt, men anlagen blandas inte.


S - svart


V - vit


SS + VV = SV = svartvit (inte grå)

Multipla alleler

Fler än två allelformer av samma gen, tex blodgrupper

Supercoilat DNA

Mer stabilt och skyddat från nedbrytning/hydrolytiska reaktioner

DNA A

Initieringsprotein för DNA-replikationen hos prokaryota

DNA B

Helikas hos prokaryota som gör replikationsbubblan större

Replication bubble

Motsvarande replikationsgaffeln i eukaryota. Bubble pga cirkulära kromosomer.

Gyras

Både coilar DNA mer och mindre

Topoisomeras 2

Hjälper de två cirkulära kromosomerna hos en prokaryot separera efter replikation

Sigma-faktor

Passar ihop RNA-polymeraset till promotorn och släpper sedan, vid prokaryot proteinsyntes

Operon

Kluster av gener i arvsmassan, som föregås av samma promotor och aktiveras/avaktiveras av samma aktivator/repressor. Transkriptionsenhet. En sträcka DNA med besläktade gener som tillsammans bildar ett gemensamt slutmål. Finns endast i prokaryota celler. Lac-operon hos E. coli mest känt.

Signalpeptider (prokaryot)

Proteiner som ska placeras i bakteriens membran, periplasmautrymme (G-) eller cellvägg har signalpeptider i änden som tar dem till rätt ställe.

Heat shock proteiner

DnaK, DnaJ, GroEL, GroES agerar chaperoner dom gör att proteiner veckas rätt efter syntes (hos prokaryota)

Polysistroniskt mRNA

mRNA som kodar för flera proteiner, bildas från ett operon

Repressor

Reglerar genexpression. Tex arginin genrepressor, som binder bär corepressor (arginin) finns, annars flyter den runt

Aktivator

Reglerar gen, tex maltos aktivator protein, som aktiveras (binder) när maltos finns, annars flyter den runt

Induktion

Reglering av proteiner som finns med i katabola reaktioner

Lac-operon

Operonet kodar för tre proteiner som alla är inblandade i nedbrytning och upptag av laktos. En lac gen repressor sitter fast på genen och blockerar syntes. Om laktos kommer intill denna repressor så binder den repressorn som då släpper mRNAt och syntes av generna kan starta. Men det är enklare och snabbare flr bakterien att bryta ned och använda glukos istället för laktos. Därför ska enzymerna för nedbrytning av laktos bara uttryckas om det inte finns glukos.


Laktos (mycket) + glukos (mycket) = reoressorn släpper, litet uttryck av generna i operonet


Laktos (mycket) + glukos (lite) = repressorn släpper, cAMP binder CRP, RNA polymerasets affinitet för promotor ökar, högt uttryck av generna i operonet



=> så att intr bakterien behöver tillverka enzymerna som bryter ned laktos i onödan om både glukos och laktos finns

Negativ reglering

Repressorproteiner förhindrar transkription. Tex. Lac operonet, repressorn binder hela tiden om inte laktos finns (repressorn deaktiveras av laktos)

Positiv reglering

Aktivatorprotein stimulerar transkription.

Transformation

Direkt upptag av arvsmassa från omgivningen, från tidigare lyserade bakterieceller. Underlättas med CaCl, is och värme. Plasmid kan tas upp genom transformation.

Transduktion

Upptag av arvsmassa (DNA-överföring) mha bakteriofager som tidigare lyserat annan bakteriecell. En bit värd-DNA från vilken del som helst av genomet, blir en del av virusets DNA i virusgenomet. Lytisk och lysogen faginfektion.

Bakteriofag

Bakterievirus

Lytisk

Bra på att lösa upp

Lysogen

Bakteriecell som en bakteriofag existerar inuti som DNA i vilostadium

Konjugation

Överföring av DNA vid cellkontakt, via pili. Givarbakterie och mottagarbakterie. Plasmid kan föras över genom konjugation.

Missense

Felaktigt protein

Nonsense

Stoppkodon ger ofärdigt protein

Epigenetik

En omprogrammering av vilka gener som slås av och på under inverkan av andra saker än DNA. Metylering av DNA, metylering och acetylering av histoner.

Metylering

En metylgrupp CH³ sätts till en molekyl

DNA metylering

Epigenetiska förändringar i genexpression. Kan orsakas av levnadsvillkor, kost, miljögifter, ålder, stress bla. Kemisk förändring av cytosin i CG-platser i DNA (ofta promotorregionen), vilket oftast stänger av gener. Katalyseras av DNA-metyltransferas

Glykokortikoidreceptor

Används för att reglera kroppens hormonella svar på stress. Höga stressnivåer kan tex ge metylering av promotorn för glykokortikoidreceptorn och därmed inhibera den genens transkription. Beteendestörningar hsr observerats vid metylering av glykokortikoidreceptorn

Genreglering

Slå på/stänga av/reglera upp/reglera ner vissa gener, i syfte av anpassning. Om ett protein inte behövs är det slösaktigt (med energi) att fortsätta producera det

Promotorregionen

Den viktigaste delen på en gen för att reglera genuttryck, då den ligger nära genen. Här binder transkriptionsfaktorer.

Transkriptionsfaktorer

Kontroll av genuttryck, formen på en transkriptionsfaktor är viktig för att den på ett bra sätt ska kunna binda till DNA. Olika former:


Helix-turn-helix


Zinc-finger


Leucine zipper


Helix-loop-helix

Helix-turn-helix

Transkriptionsfaktor

Zinc-finger

Transkriptionsfaktor

Leucine zipper

Transkriptionsfaktor

Helix-loop-helix

Transkriptionsfaktor

Enhancer

En stimulerare - regulatoriska sekvenser som binder transkriptionsfaktorer och aktiverar genuttryck. Ligger långt ifrån genen. Kan ge upphov till böjningar i DNAt, som triggar transkriptionen

Stress response element

Region i anslutning till promotorn för flera gener som alla är inblandade i att svara på ett visst stimuli, (tex stress) som binder transkriptionsfaktor

Posttranskriptionell kontroll

Tranakriptionsmodifieringar av mRNA som ett led i reglering av gentranskription - transportering av mRNA ut från kärnan, skydd, splicing (poly A), små RNA

Alternative splicing

Pre-mRNA kan spliceas oliks i olika vävnader, dvs när intronerna spliceas bort, kan de återstående exonerna klistras ihop på olika sätt, för att samordna flera aktiveringar

Differentierad cell

En cell med specifika gener påslagna och andra avslagna, dvs den har fått sin uppgift. Odifferentierade celler är mer stamcellslika

Onkogener

Normala gener som genom genetiska avvikelser ger malign transformation av cellen, det vill säga en gen som ger upphov till en felaktig proteinprodukt vars bristande funktion ger upphov till en tumörcell. I de flesta fall innebär detta en överaktiverad gen.

Epigenetisk nedärvning

Metylering i somatiska celler kan ärvas, medan könscellers metylering ofta tas bort när de bildas.

Maintenance metylas

Enzym som katalyserar formation av 5-metylcytosin i en ny DNA-sträng, vilket leder till att epigenetiska förändringar kan ärvas

DNA-metyltransferas

Enzym som katalyserar DNA- metylering

Demetylas

Enzym som kan katalysera borttagandet av en metylgrupp

De-aminering (av Cmet)

Spontan borttagning av amingruppen på metylcytosinet Cmet, vilket ger basen Thymin istället, som inte kan korrigeras utan leder till mutation.

Acetylering (av histoner)

Ändrar laddningen av histonerna vilket leder till att DNA blir mindre packat runt dem och gör dem tillgängliga för transkription

Deacetylering (av histoner)

Acetylgruppen tas bort från histonproteinet och den starka attraktionen mellan DNA och histon ökar. Nukleosomen stängs och DNAt blir otillgängligt för transkription. Mediciner som används som cancerbehandling agerar ofta deacetylerande på histonproteinerna.

Eukromatin

DNA kan läsas av, löst packat

Heterokromatin

DNA kan inte läsas av, tätt packat

Vildtyp

Den normala

Mutant

Genetisk förändring i arvsmassan i en eller flera baser, som kan ge upphov till en aminosyra på en eller flera positioner, som kan vara felaktigt eller icke-fungerande. Om en bas byts ut i en reglerdel av DNA så kan vi få en felaktigt reglerad produktion av proteiner.

Tyst mutation

Mutation som inte påverkar ett proteins fenotyp, samma funktion so vanligt

Frameshift

Om en extra aminosyra sätts in eller tas bort blir det en förskjutning i läsramen, vilket ger helt andra aminosyror och alltså inget fungerande protein

Insertion

En slags genetisk förändring där en ny bit arvsmassa (bas/baser) har satts in i arvsmassan

Deletion

En slags genetisk förändring där arvsmassa (bas/baser) har försvunnit

Translokation

En bit arvsmassa har satt sig i en annan kromosom

Kromosomavvikelse

Stora skador på kromosomer eller då kromosomerna finns i ett annat antal (karyotop förändring)

Karyotyp

Kromosomsammansättningen

Serologiska test

Detekterar antikroppar mot bakterier eller antigener (proteiner) från bakterier. Immunoassays, agglutination, immunofluorescense.

Immunoassays

Serologiska test

Agglutination

Serologiska test

Immunofluorescense

Serologiskt test

Bakteriostatiskt ämne

Inhiberar bakterietillväxt, men dödar inte

Bakteriocidalt ämne

Dödar bakterieceller

Bakteriolytiskt

Lyserar bakterieceller

Antibiotika

Verksamma ämnen mot bakterier. Hämmar bakteriens proteinsyntes, dess cellväggssyntes eller RNA-syntes. Viktigt att försöka hitta mekanismer och strukturer att angripa som inte finns hos oss, å eventuella läkemedel påverkar våra normalfunktioner i så låg grad som möjligt

Sepsis

Blodförgiftning. Nedsatt immunförsvar, hög ålder, immunsupprimerande läkemedel, cytostatika (cellgifter), leukemi osv kan öka risken för sepsis.

Cytostatika

Cellgifter

Meningit

Hjärnhinneinflammation

Pneumoni

Lunginflammation. Orsakas oftast av Pneumokock-bakterier.

Beta-hemolys

Lysering av röda blodkroppar

Skadad slemhinnebarriär

Tillstånd efter en virusorsakad luftvägsinfektion som ökar risken för att drabbas av sekundära bakterieinfektioner.

Otit

Öroninflammation

Sinuit

Bihåleinflammation

Enterobacteriaceae

Tarmbakterier i normalfloran

UVI

Urinvägsinfektion, orsakas oftast av E. coli

Patogen

Sjukdomsframkallande (påvisar virulens)

Virulens

Förmåga att orsaka sjukdomar

Virulensfaktorer

Faktorer som ger bakterien en ökad virulens ex. kapsel, pili, lipteikonsyra (adhesion); endotoxin, exotoxin, superantigen (invasion);

Normalfloran

Bakteriefloran som vi normalt har på och i våra kroppar. Normalfloran är i vanliga fall apatogen, men är i själva verket opportunistiskt patogen.


Agerar fysiskt hinder/barriär mot andra bakterier; de tar näring och kan utsöndra ämnen som ör toxiska för andra bakterier; producerar K-vitamin; grundaktiverar immunförsvaret.

Apatogen

Icke-sjukdomsframkallande

Opportunistiskt patogen

Är sjukdomsframkallande om tillfälle ges, tex brännskadad patient.

Lavemangdonation

Tillförande av bakterier genom ändtarmen, då patientens normalflora är rubbad pga tex långvarig behandling med bredspektrum antibiotika

Superantigen

Virulensfaktor som överaktiverar immunförsvaret och leder till cellförstörelse, även vävnadsförstörelse. Detta kan bla medföra att bakterien kan invadera djupare in i kroppen.

Koleratoxin

Går in i cellen och påverkar cellens förmåga att hålla vätska och näring, uppstår en störning av metabola processerna

Stelkrampstoxin

Blockerar utsöndringen av glycerine och inhiberar därmed att muskeln slappnar av

Botuliniumtoxin

Blockerar utsöndringen av acetylcholine och inhiberar därmed muskelkontrahering, vilket kan tex ge upphov till andningsproblem

Difteritoxin

Inhiberar proteinsyntesen, medför celldöd

Enterotoxin

Produceras av staff aureus bakterier, ger oerhört snabb effekt även efter uppvärmning av maten de lever i pga att uppvärmning inte förstör toxinerna, bara bakterierna.

Sjukdomsutveckling

Påverkas av:


1. Människans (värddjurets) mottaglighet för infektionen


2. Bakteriens virulens och mängden bakterier


3. Tillfälligheter i miljön (temperatur, fuktighet, pH osv)

Människans försvar

Barriärer - mekaniska (hud, slemhinna, sekretion) och kemiska (lågt pH, galla, normalflora)


Immunförsvaret - celler (vita blodkroppar), proteiner (antikroppar)


Fysisk och psykisk balans som påverkar immunförsvaret och barriärer

Smittvägar

Peroral smittspridning


Luftsmitta


Vektorsmitta


Kontaktsmitta


Blodsmitta


Sexuell smitta

Peroral smittspridning

Intag via munnen