Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
39 Cards in this Set
- Front
- Back
Slægtskriterier (primære tests): |
• Form • Farve (Gram) • Bevægelighed (flageller) • Sporer • Katalase • CytochromOxydase C • Aerob/Anaerob vækst • Co2 krævende • Oxidativ/fermentativ glukoseomsætning • Vækst på McConkey agar (galde resistens) • Vækst ved 37 °C • Nitrat reduktion |
|
Kolonimorfologi: |
Kolonidiameter: pinpoint, lille, mellemstor, stor Profil: lavkonveks, konvenks, flad, navle, top Rand: helrandet, uregelmæssig, filamentøs Overflade: glat, mucoid, mat Farve: grå, hvid, gul, rød, grøn Hæmolyse: alfa, beta, delta, dobbelt m.v. |
|
Hæmolyse: |
Bakterier generelt: - Komplet hæmolyse = Beta-hæmolyse - Inkomplet/grønfarvning = Alfa-hæmolyse Staphylococcus: - Komplet, bred hæmolyse = Alfa-hæmolyse - Komplet, smal hæmolyse = Delta-hæmolyse - Inkoomplet hæmolyse = Beta-hæmolyse - Dobbelt hæmolyse, hvor den yderste hæmolyse er inkomplet = Beta-delta-hæmolyse |
|
Gram-farvning: |
En måde at opdele bakterier i to grupper. Hvordan bakterier lader sig indfarve med et violet farvestof: metylviolet. De Gram-positive bakterier har ikke nogen ydre membran. Denne forskel betyder, at bakterierne antager forskellig farve ved Gram-farvning Gram-positive: blå/lilla Gram-negative: røde Ved gramfarvning kan man også se, om der er tale om en kok eller en stav OBS! Mykoplasmer hører ikke ind under denne inddeling |
|
KOH: |
En anden måde at teste for gram-pos eller gram-neg: En dråbe 3% kaliumhydroxid tilsættes kolonimasse på et objektglas Slimdannelse = gram-negativ Fx E. coli |
|
MOT: |
Motilitet kan testes direkte i mikroskop, eller i halvflydende medie, hvor man stikker en podepind halvt ned i et rør og inkuberer. Herefter kan man se om bakteriemassen har bevæget sig væk fra stikket (har flageller). Fx Vibrio NB! Yersinia og Listeria er kun motile ved 25 C Det er desuden sjældent at kokker er motile! |
|
Endosporer: |
Det er kun Clostridium- og Bacillusarter der udvikler sporer Endosporer kan ses ved mikroskopi, og gøres ofte lettere at se ved fasekontraktmikroskopi eller nigrosin-farvning (bakterierne farves ikke, men fremtræder lyse på sort baggrund) |
|
Katalase: |
Om bakterien har enzymet katalase og kan spalte hydrogenperoxid (brintoverilte) til hydrogen og oxygen Der tilsættes hydrogenperoxid til prøven Positiv: der dannes ilt (bobler) --> de fleste gram-neg bakterier Negativ: der dannes ikke ilt fx Streptococcer |
|
Cytochromoxidase: |
Cytochrom C er en del af elektrontransportkæden hos bakterien. En dråbe reagens indeholdende TMPD tilsættes filterpapir og kolonimasse tilføjes. TMPD virker som en kunstig elektrondonor for enzymet oxidase. Den oxiderede reagens danner det farvede stof indophenol blå Positiv: blå/lilla farvning (oxiderer cyt C) fx Bacillus anthracis Negativ: ingen farvning (reducerer cyt C) |
|
VLHF: |
VL-halvflydende medie til detektion af vækst Vækst i overflade: aerob fx Pseudomonas Aeruginosa og Rhodococcus equi Vækst i bund: anaerob fx Fusobacterium Vækst i hele prøven: fakultativ fx E. coli Hvis prøven bliver rød/lyserød i toppen, er det fordi den reagerer med ilt |
|
Candle jar: |
Også kaldet CO2 dyrkning. Mange bakterier vokser bedre med forøget CO2 koncentration = capnofile bakterier (i stedet for atmosfærens 0,3 %) Podede agarplader sættes i lukket beholder, hvor der tændes et stearinlys, hvormed ilt-forholdende bliver således: 10-15% ilt, 5% CO2 Fx Campylobacter |
|
O/F: |
Test om bakterien nedbryder glucose oxidativt eller fermentativt Gul farve i bund eller hele røret: fermentativ (danner meget syre) fx Enterobacteriaceae Gul farve i toppen: oxidativ (danner lidt syre) fx Micrococcus Grøn/blå: ikke podet eller negativ (kan ikke nedbryde glucose) fx Moraxella |
|
Nitratreduktion: |
Nit 1 og nit 2 tilsættes prøven: Rød farve: nitrat er reduceret til nitrit (=positiv) Klar farve: negativ ELLER nitrit er reduceret videre (=positiv) Dette kan klargøres ved at tilsættes zink: hvis farven nu bliver rød, er det nitrat i prøven og IKKE nitrit (=negativ). Hvis prøven forbliver klar, har der været nitratreduktion (=positiv). Positiv: fx Clostridium perfringens Negativ: fx Fusobacterium |
|
NA agar: |
Nutrient agar Kan bakterien vokse uden specifikke vækstfaktorer (blod, serum) Fx Staph Aureus, Klebsiella pneumoniae, Salmonella typhimurium |
|
MacConkey agar: |
Både selektiv og indikativ medie: Selektiv: indeholder galdesalte og krystalviolet, som hæmmer de fleste gram-pos Vækst, men ingen rødfarvning fx Salmonella Indikativ: rødfarvning ved fermentering af laktose (koliforme bakterier) fx E. coli |
|
Mannitol saltagar: |
Høj saltkoncentration (7,5 %) Både selektiv og indikativ medie Selektivt: kun staphylococcer kan vokse, til trods for saltkoncentrationen Indikativt: Mannitol-fermentering (gulfarvning) fx Staph. Aureus |
|
Æsculin-blodagar: |
Æsculin (fluorescerende) hydrolyseres til æsculitin -> æsculitin danner kompleks med jern Sort/mørkfarvning: bakterien kan hydrolysere æsculin: der ses en jernudfældning. Ingen fluorescerende effekt Fx Klebisella (99%) og E. coli (35%) |
|
Sulfit jern-agar: |
Sulfitreduktion: sultif til hydrogensulfid (hydrogensulfid danner kompleks med jern) Na2S2O3 → H2SH2S + Fe++ → FeS Sortfarvning i stik: positiv (sulfitreducerende) Fx Clostridium sporogenes |
|
Æggeblomme-agar: |
Om bakterien kan fraspalte fedtsyrer (lecitinase) Hvid zone omkring koloni: positiv Fx Bacillus cereus |
|
BLSF agar: |
= Brilliantgrøn laktose sakkarose phenolrødt Brilliantgrønt hæmmer de fleste gram-pos Gult farveskift = fermentering af laktose og/eller sakkarose Kan anvendes sammen med MacConkey agar, for at afgøre om bakterien KUN kan fermentere laktose |
|
ONPG: |
ONPG (analog til laktose) (orto-Nitrophenyl-beta-D-Galactopyranosid) spaltestil en gulfarvet nitrophenol af enzymet beta-galactosidase (lactase) Gul: positiv (har beta-galactosidase aktivitet (kan fermentere ONPG) fx Staph. pseudointermedius Klar: negativ (kan ikke fermentere ONPG) |
|
Koagulase-test: |
Rør med citratstabiliseret plasma (fx fra hest eller kanin) podes og inkuberes, hvorefter der undersøges for koagulation Positiv: kun staphylococcer (subsp. varierer efter typen af serum) |
|
CAMP-faktor: |
Om bakterien laver forstærket eller hæmmet hæmolyse: lyserer blod, når erythrocyterne er påvirket af beta-hæmolyse fra Staph. Aureus Fx Listeria monocytogenes |
|
Loeffler serum (skråserum): |
Om bakterien kan nedbryde serum (proteinaser) "Huller" i skråserum: positiv fx Trueperella pyogenes Komplet skråserum: negativ |
|
Indol: |
Tryptofan --> (tryptofanase) --> fraspalter alanin-sidekæden fra tryptophan og danner indol Rød i toppen: positiv fx E. coli Gul i toppen: negativ |
|
Methylrødt (MR): |
pH indikator, som oftest anvendes til differentiering mellem Enterobacteriaceae. Tilsætning af methylrødt til prøve: Rød: positiv (mixed acid pathways) fx Salmonella, E. coli og Yersinia Gul: negativ |
|
Vogues Proskauer (VP): |
Detekterer acetoin (butandiol fermentation) Bruges ofte til at differentiere Bacillus-arter Rød/pink: positiv Gul/brun: negativ fx Bacillussphaericus |
|
TSI-agar (tre-sukker-jern): |
Anvendes ofte til differentiering mellem Enterobacteriaceae. Tester sukkerfermentering (glucose, laktose og sukrose): Pink overfalde, gul bund: glucose-fermenterende fx Salmonella Gul overflade, gul bund: laktose og/eller sukrose (+ glucose) fermenterende fx E. coli Orange: upodet/negativ Tester desuden for: -Thiosulfat reduktion --> H2S (sortfarvning i stik) fx Salmonella og Erysipelothrix -Anaerob + aerob zone: om der dannes gas + gas: fx E. coli - gas: fx Yersinia |
|
Durham-rør: |
Dannelse af CO2 og H2, som ses ved små glas med bunden opad i podede rør Hvis bakterien danner gas ved fermentering, ses luft i disse glas Fx Proteus Mirabilis |
|
Urinstof: |
Urea omdannes til CO2 og ammoniak (urease) -> stigning i pH Pink/lilla: positiv fx Klebsiella pneumoniae Orange: upodet Gul: negativ |
|
Simmons citrat: |
Minimalmedium, hvor citrat er eneste kulstofkilde og ammonium er eneste kvælstofkilde Blå: positiv (vækst) fx Proteus mirabillis og Salmonella Grøn: upodet/negativ |
|
Syrefasthed: |
Bakterier, som ikke kan affarves med syre Kun mycobacterium |
|
V-faktor (NAD) behov: |
Nogle bakterier kan ikke selv syntetisere NAD (V-faktor) og er afhængig af at en anden bakterie (eller værten) leverer denne vigtige co-faktor Fx Actinobacillus pleuropneumoniae Man kan dyrke bakterien på chokoladeagar (lyseret blod agar), eller man kan påsætte tabletter indeholdende NAD på agarpladen Man kan desuden dyrke en "ammekultur" = en bakterie, der kan danne NAD, fx Acinetobacter, E. coli og Staphylococcer. Her vil der ses satellitvækst, af den bakterie med V-faktor-behovet (vokser kun tæt på ammekulturen) |
|
Sabouraud agar: |
Selekterer for svampe: medium med lav pH og forholdsvis høj koncentration af sukker. Består af: 1% peptone 4% glucose 1,8% agar pH 5,5 Eller pH 7 og tilsat chloramphenicol 25 μg/ml OBS! Længere inkubationstid (svamper er langsommere om at vokse) 1-2 uger Fx Aspergillus, Candida, Malasezzia |
|
Lactophenol cotton blue: |
Farvning som bruges til svampe Phenol dræber svampen, cotton blue farver svampens cellevæg Kan også bruges til alger! |
|
PCR: |
En gen-opformeringsteknik, hvor man opkopierer (fordobler) bestemte DNA-sekvenser i en række gentagne cyklusser. 1. Opvarmning medfører denaturering af DNA 2. DNA-polymerase kan kun kopiere DNA, hvis der er korte primer-sekvenser af komplementær-DNA til rådighed (der skal bruges to forskellige primere - én til start af kopiering i hver retning). Primerne binder til DNA'et der, hvor kopieringen skal begynde, under nedkøling 3. Elongering (dannelse af de nye, komplementære DNA-strenge) Efter opformering, kan man tilsætte DNA'et til en brønd i en gelelektroforese, som viser størrelsen på genet (bp), ved at sammenligne med en kontrolbrønd med kendte genstykker |
|
Sekventering af DNA: |
Kortlægningen af den nøjagtige DNA-sekvens, altså rækkefølgen af nukleotiderne A, T, C og G DNA-sekventeringen foregår ved en særlig kopiering af DNA'et, hvor de brugte byggesten (nukleotiderne) bærer en fluorescerende gruppe. I aflæsningsresultatet er hver farveplet et område, hvor en gruppe af ens DNA-strenge sekventeres. Ved brug af farvekoderne, kan sekvenserne derfor afkodes. |
|
Maldi-tof: |
= matrix-assisted laser desorption ionizationtime-of-flight Ved denne metode sammenlignes proteinsammensætningeni en koloni, med proteinsammensætningen i flere tusinde referencestammertilhørende forskellige species. En metalplade tilsættes en LILLE mængde kolonimasse og 1 µl CHCA matrix Pladen kører ind i et spektrometer, der måler sammenhængen imellem proteinernesstørrelse og "flyvetid", samt deres forskelligespektre. Metalpladenkan tage 96 prøverad gangen. |
|
API 20E: |
Et standardiseret identifikationssystem for enterobacteriaceae: En plastikbakke med kamre, der indeholder 20 miniature biokemiske tests De fleste kamre tilsættes blot kolonimasse blandet med sterilt, destilleret vand, og aflæses efter inkubation. Andre skal tilsættes yderligere reagenser efter inkubation, inden aflæsning |