Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
67 Cards in this Set
- Front
- Back
מה מבנה המיקרוטובולי?
|
דימרים של תת יחידות אלפא (-) ובטא (+) יוצרים פרוטופילמנט. 13 פרוטופילמנטים מקבילים יוצרים סיב חלול בקוטר 25nm.
|
|
כיצד נבנה המיקרוטיובולי?
|
מרבית המיקרוטובולי מניצים מ-MTOC, כמו צנטרוזום או גופים באזליים (ב-cilia וב-flagella). הוא מכיל את ה-γ-tubulin ring complex המשמש כפיגום לתחילת פילמור הסיב ע"י דימרים של α/β-tubulin מהקצה ה-(-) לקצה ה-(+).
הסיב עצמו נמצא במצב של dynamic instability, כלומר, כל הזמן הוא מתארך ומתקצר מהקצה ה-(+). גם תת יחידה אלפא וגם תת יחידה בטא קושרות GTP. בתת יחידה אלפא ה-GTP משמש בתפקיד מבני בעוד שבתת יחידה בטא הוא יכול לעבור הידרוליזה ל-GDP ולהקטין את האפיניות של הסיב לדימרים. פילמור מהיר -> GTP-cap שמייצב את המולקולה. |
|
Capping proteins
|
נקשרים לקצה ה-(+) של המיקרוטובולי ומונעים דה-פולימריזציה שלו.
|
|
סוגי המטען (cargo) של המיקרוטובולי
|
1. חלבונים
2. ואסיקולות 3. אורגנלות |
|
מה כיוון התנועה של קינזין על מיקרוטובולי?
|
מה-(-) ל-(+), חוץ מקינזין 14.
|
|
מה כיוון התנועה של דינאין על מיקרוטובולי?
|
מה-(+) ל-(-).
|
|
כיצד נעים חלבוני המנוע קינזין ודיאנין על סיב המיקרוטובולי?
|
ה-motor heads נעים על סיב המיקרוטובולי ע"י הידרוליזה של ATP-> ADP + pi שגורמת לשינוי קונפורמציה. ה-tail נושא את המטען.
|
|
קוהזין
|
חלבון בצורת טבעת המצמיד את הכרומטידות האחיות.
|
|
קונדנסין
|
חלבון בצורת טבעת אשר אחראי על דחיסת הדנ"א במיטוזה.
|
|
שלושת סוגי המיקרוטובולי במיטוזה
|
1. aster micritobules
2. interpolar micritobules 3. kinetochore micritobules |
|
מה תפקיד הדיאנין בזמן המיטוזה?
|
הוא קושר את הממברנה הפלזמטית כמטען ונע לכיוון הקצה ה-(-) של המיקרוטובולי. כיוון שהממברנה קבועה במקום הוא למעשה מקרב את הצנטרוזום לממברנה.
|
|
separase
|
בתחילת האנאפזה separase מפרק את הקוהזין ומאפשר את הפרדת הכרומטידות האחיות.
|
|
securin
|
לפני תחילת האנאפזאה האנזים separase מעוכב ע"י קישור לחלבון securin. כשכל הקינטוקורים נמצאים במצב יציב ומחוברים נכון, ה- Anaphase Promoting Complex - APC/C
מאוקטב. יש לו פעילות של E3 ubiquitin ligase שמזהה ונקשרת ל-securin מה ששולח אותו לפירוק בפרוטאוזום ומפעיל את ה-separase. |
|
פרוטאוזום
|
קומפלקס חלבונים בעל יחידה קטליטית שמפרקת חלבונים לפפטידים קצרים ושתי יחידות רגולטוריות שמזהות ומכניסות רק חלבונים עם multiubiquitin chain. הסמן נקשר ליחידה הרגולטורית ונחתך. יש מיחזור שלו.
|
|
מה הם שני שלבי האנפאזה?
|
1. אנפאזה A - כרומטידות אחיות נפרדות בגלל התקצרות של ה-kinetochore micritobules בשני הכיוונים. אין הפרדה של הקטבים.
2. אנפאזה B - הפרדה של ה-mitotic poles בגלל התארכות של ה-interpolar micritobules. |
|
Nocodazol
|
משמש בכימותרפיה. קושר תת יחידות של מיקרוטובולי ולכן מעכב פולימריזציה של הסיב. מונע התארכות של ה-interpolar micritobules ולכן התא לא מצליח להתחלק.
|
|
Taxol
|
משמש בכימותרפיה. מייצב מיקרוטובולי ולכן מונע דה-פולימריזציה של הסיב. מונע התקצרות של ה-kinetochore micritobules ולכן פוגע בחלוקת התא.
|
|
כיצד נוצרת מעטפת הגרעין מחדש בטלופזה
|
דה-פוספורילציה של תת היחידות של הלמינה והרכבה ספונטנית שלהם מחדש.
|
|
גמטה
|
תא מין. מספר הפלואידי של כרומוזומים.
|
|
זיגוטה
|
ביצית מופרית. מספר דיפלואידי של כרומוזומים.
|
|
Gain of function mutation
|
דומיננטית
|
|
Loss of function mutation
|
כמעט תמיד רצסיבית
|
|
ללא רקומבינציה הומולוגית, כמה סוגי גמטות יכולות היו להיווצר?
|
2^n
n=מספר זוגות כרומוזומים הומולוגים |
|
Synaptonemal complex
|
קומפלקס חלבוני שנוצר בפרופאזה 1 של המיוזה ונועד לקשור בין כרומוזומים הומולוגים לצורך זיווגם כביוולנט ויצירת סינפסה. השלבים ביצירת הקומפלקס: לפטוטן, זיגוטן, פכיטן, דיפלוטן, דיאקינזיס.
|
|
Interphase 2 / Interkinesis
|
זמן מנוחה בין מיוזה 1 למיוזה 2.
|
|
מה ההבדל בין פרופאזה ופרומטאפזה 1 ובין פרופאזה ופרומטאפזה 2 במיוזה?
|
פרופאזה 1 - צימוד הומולוגים ורקומבינציה גנטית.
פרומטאפזה 1 - פירוק מעטפת הגרעין ותנועה של ההומולוגים לעבר מישור החלוקה. פרופאזה 2 - דחיסת כרומטידות אחיות. פרומטאפזה 1 - פירוק מעטפת הגרעין ותנועה של הכרומטידות לעבר מישור החלוקה. |
|
ההבדל בתוצר הסופי בין מיטוזה למיוזה
|
מיטוזה - 2 תאי בת זהים גנטית.
מיוזה - 4 תאי בת שונים גנטית. |
|
Homogenization
|
שיטה לפרק את הממברנה תוך השארת האברונים שלמים (בניגוד לסוניפיקציה ו-detergent lysis) ע"י בוכנה מסתובבת. התוצר הסופי נקרא הומוגנאט.
|
|
Pellet
|
המשקע שנותר לאחר צנטריפוגה (הנוזל שמעליו נקרא supernatant).
|
|
צנטריפוגה דיפרנציאלית
|
צנטריפוגה בשלבים במהירות שהולכת וגדלה.
|
|
Equilibrium gradient centrifugation
|
Isopycnic density gradient centrifugation
|
|
2 סוגי ה-ER
|
1. Smooth ER
2. Rough ER - שם מתבצע התרגום |
|
SRP
|
קומפלקס חלבוני שאחראי להוביל ריבוזות שמתרגם חלבון עם פפטיד סיגנל לתעלת הטרנסלוקציה שם הוא נקשר לרצפטור ל-SRP ומתנתק תוך השקעת אנרגיה (הידרוליזה של GTP).
מכיל: translational pause domain, structural RNA molecule, signal sequence binding pocket, GTPase & SRP recoptor binding site. |
|
חלבון ממברנאלי type 1
|
מכיל signal sequence בקצה האמיני ו-stop transfer sequence (רצף הידרופובי) באמצע כך שהקצה האמיני של החלבון נמצא בתוך ה-ER lumen והקצה הקרבוקסילי בחוץ.
|
|
חלבון ממברנאלי type 2
|
מכיל start transfer sequence במרכז החלבון וללא stop transfer sequence כך שהקצה הקרבוקסילי של החלבון נמצא בתוך ה-ER lumen והקצה האמיני בחוץ.
|
|
double pass membrane protein
|
מכיל start transfer sequence במרכז החלבון ומתורגם עד ה-stop transfer sequence כך שגם הקצה האמיני וגם הקצה הקרבוקסילי של החלבון נמצאים בחוץ.
|
|
Multi pass membrane protein
|
מכיל כמה אזורים בעלי signal sequence ו-stop transfer sequence כך שנכנס ויוצא מהממברנה לסירוגין.
נקרא גם polytopic protein. |
|
אילו מודיפיקציות פוסט תרגומיות עוברים החלבונים המופרשים ב-ER
|
1. קיפול נכון ובקרת איכות
2. יצירת קשרי S-S 3. הוספה קוולנטית של סוכר (גליקוליזציה) -> גליקופרוטאין 4. הרכבה של חלבונים מולטימרים |
|
איזה חלבון מגן על החלבונים מפני קיפול לא נכון ע"י קשירה לאזורים הידרופוביים? מדוע?
|
צ'פרון. מונע אגרגציה של אזורים הידרופוביים בזמן הסינתזה.
|
|
מה עשוי לגרום לקיפול לא נכון של החלבון?
|
point mutation
אין די שפרונים |
|
protein disolfide isomerase (PDI)
|
אנזים בעל 2 קבוצות sulfhydryl שיכול:
1. לחמצן חלבון מחוזר, ליצירת קשר S-S (האנזים מתחיל במצב מחומצן והופך למחוזר). 2. איזומרציה של קשרי S-S לא נכונים (האנזים מתחיל במצב מחוזר). |
|
N-linked glycosylyation
|
ב-ER. הוספת N-אצטיל גלוקוזאמין (נגזרת של גלוקוז עם קבוצת N-אצטיל על פחמן 2 במקום OH) על הקבוצה האמינית בשייר של Asn בתוך קונטקסט של אתר גליקוזילציה מסוג N. ההוספה עשויה להיות של N-אצטיל גלוקוזאמין לבד או עם עוד סוכרים שקשורים אליו => מתקבל N-linked glycoprotein.
|
|
O-linked glycosylation
|
בציטוזול (הוספת יחידה אחת של N אצטיל גלוקוזאמין) ובגולג'י (הוספת סוכרים אחרים). גליקוזילציה על שיירי Ser או Thr.
|
|
האם N אצטיל גלוקוזמין יכול להיקשר בקשר O-linked לחלבון הפרשה?
|
אך ורק על חלבון ממבראנאלי על החלק החוץ ממברנאלי שבא במגע עם הציטוזול ואך ורק יחידה אחת.
|
|
האם חלבונים ציטוזוליים/גרעיניים יכולים לעבור גליקוזילציה?
|
אך ורק של תוספת N אצטיל גלוקטזמין אחד בקשר O-linked. כל יתר סוגי הגליקוזילציות הם על חלבוני הפרשה (כולל חלבונים ממברנאליים).
|
|
אתר גליקוזילציה מסוג N
|
Asn-X-Ser/Thr
X - כל חומצה אמינית חוץ מפרולין |
|
כיצד נוצרים פוליסכרידים?
|
1. הפעלת סוכר ע"י חיבורו ל- UDP בתגובת קונדנסציה:
sugar-OH + UTP -> sugar-o-udp + H2O + Pi 2. הוספת סוכר לשרשרת סוכרים תתבצע תוך שחרור UDP. הקישור יכול להיות לכל קבוצת OH ולא חייב להיות לינארי. |
|
מה המנגנון של הוספת מונו/אוליגוסכריד ב-ER (גליקוליזציה מסוג N)?
|
שרשרת סכרידים נבנית על dolichol diphosphate, ליפיד שנעוץ בממברנת ה-ER מצידה הלומינלי. ומשם עוברת לחלבון על אתר גליקוליזציה מסוג N.
|
|
unfolded protein response
|
כאשר יש הרבה חלבונים שהם misfolded (כתוצאה ממוטציה, תנאים דהנטורטיבים ועוד) הם מצטברים ואין מספיק שפרונים/מערכות דגרדציה לטפל בהם. נוצר ER stress. יש רצפטורים ממברנאליים בצד הפנימי של ה-ER שמסוגלים לקשור חלבון שהוא misfolded -> מוביל ל-unfolded protein response שגורמת ליצירת עוד שפרונים (מתורגמים לתוך ה-ER) ועוד פרוטאוזומים.
|
|
smooth ER
|
שם מתרחשת סינתזה של ליפידים, פוספוליפידים וסטרואידים. מכילה את מאגר הסידן של התא (בנוסף למיטוכונדריה).
|
|
sarcoplasmic reticulum
|
ה-smooth ER במיוציטים (תאי שריר). שואבת +Ca2 מהציטוזול, מאחסנת אותו ומשחררת אותו כשיש סטימולציה של שריר.
|
|
secretion pathway
|
ה-ER -> גולג'י -> אורגנלות/ממברנה פלזמטית/ECM
|
|
Golgy stack
|
אפרטוס גולג'י. נקרא כך כי נראה כמו ערמת צלחות אחת על השניה.
|
|
מה תפקיד הגולג'י?
|
עיבוד הסכרידים שהוספו ב-ER על הגליקופרוטאינים ובפרט: זרחונם, הורדת רוב הסכרידים על השרשרת מסוג מאנוז (high mannose type->complex type), הוספת מונוסכרידים נוספים עם/בלי הסתעפויות ולרוב, הוספת חומצה ציאלית בסוף השרשרת (N acetylneuraminic acid=NANA). סוכר עם ראש קרבוקסילי שטעון שלילי ב-PH פיזיולוגי.
ה-complex type olygosacharid מכתיב את יעדו הסופי של הגליקופרוטין. |
|
גולג'י - cis face
|
משם נכנסים חלבוני ההפרשה שמגיעים מה-ER.
|
|
גולג'י - trans face
|
משם יוצאים חלבוני ההפרשה.
|
|
CGN
|
cis golgy network=ER to golgy intermedial compartment (ERGIC)=
vasiculo-tubular clusters (VTC) שם מתרחש sorting וזרחון סוכרים על הגליקופרוטאינים. |
|
צלחת cis
|
שם מתרחשת הסרת רוב יחידות המאנוז.
|
|
צלחת medial
|
שם מתרחשת הוספת GlcNAC.
|
|
צלחת trans
|
שם מתרחשת הוספת גלקטוז ו-NANA.
|
|
TGN
|
שם מתרחשת הוספת גופרית+sorting.
|
|
COP2
|
ציפוי לואסיקולות מה-ER לגולג'י.
|
|
COP1
|
ציפוי לואסיקולות שחוזרות מהגולג'י ל-ER.
KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 1. |
|
קלטרין
|
ציפוי לואסיקולות שנכנסות מהממברנה הפלזמטית לפנים התא ומהגולג'י לאורגנלות השונות.
|
|
cargo receptors
|
קושרים חלבונים על מנת שיוכלו להיכנס לואסיקולה על מנת להנץ מהממברנה.
|
|
ER exit site
|
שם מצטברים ה-cargo receptors ומנצים משם.
|
|
Sar-GDP
|
משתתף ביצירת ואסיקולות מסוג COP2. נקשר לחלבון ממברנאלי באזור ה-ER exit site של הואסיקולה שגורם לשחלוף GDP ב-GTP. כשהואסיקולה מתקרבת לגולג'י Sar-GTP עובר הידרוליזה לSar-GDP וגורם ל-uncoaring של הכיסוי. מתקבלת naked vesicle שעוברת עגינה לממברנת הגולג'י ע"י חלבוני SNARE.
|